通过获得新产品或新市场，并购的效果有可能是立竿见影的。但是要持续保持并购后所获得的竞争力就是一项很艰巨的任务，其中，信息系统的融合则是最复杂的环节。
为了完成一个并购交易，首先，企业的信息系统整合战略必须紧密结合公司的总体战略目标，并进一步细化，以满足每一个业务单元的独特需求。接着，还要组建高效的系统整合团队，恪守目标和经营商业的方式，并拟定各种保证信息系统顺利整合的举措；另外，还要建立和保持与企业领导层和业务部门领导的合作和伙伴关系，以准确评估信息系统整合对业务的影响。
整合过程的建立
在合并或者收购后做信息系统整合，可以将合并或者收购所带来的改变贯穿于整个公司业务领域。
信息系统整合过程包括在过渡期间建立明确的领导层和清晰地定义角色，包括授权整合团队成员，就信息技术进行有效的沟通，并采取果断行动等等重要活动。
提早计划并清晰认识新合并公司的目标，是进行信息系统成功整合必不可少的因素。公司目前和未来的业务模式需求将决定合并后系统整合的策略，可选的方式包括接着使用一个公司的系统，或使用两家公司系统中最好的部分，或支持开发单独系统，以实现该公司快速有效地达到计划的最终状态。
实施信息系统整合的过程中，涉及所有主要信息系统领域，全面评估包括应用系统，基础设施，IT 环境，组织，费用支出，资产等多个领域，就可形成一体化的、包含机遇和挑战的完整场景。新的信息系统的价值应该是建立在增加收入，节约成本，缩短时间，降低工作难度，和规避风险的基础上。
对于新合并的公司，这种前瞻性的思维方式需要一个强大的决策和权力结构来保证。有了这样一个结构，公司可以不用担心任何新出现的问题是否可以解决，与公司的总体目标和战略是否一致，是否可以最大限度地减少或避免干扰业务运行。当企业希望用系统整合来带动内部业务流程整合时，这一点尤为重要。
规划和执行力要在第一天就启动
即使你为整合过程做了很多的打算，但如果缺乏适当的规划和执行，在项目结束时也很可能出错。开局是确定平稳过渡的关键操作时间点。
因为信息系统是连接内部和外部通信的中枢，某些系统和管理报告工具在第一天运营时就是必须的。这些系统通常包括用于连接内部和外部用户临时系统解决方案，提供可选择的关键数据和应用程序访问，提供服务台支持，并支持财务报告和人力资源的具体工作。
整合开始时的关键举措和项目执行状态应严格管理，因为它们往往涉及到复杂但价格高却可能是一劳永逸的解决方案。此外，这些系统的任何问题，将导致客户和员工之间的挫折感，并有可能破坏业务运营。
另一个当务之急是建立基本原则，以此决定具体系统整合项目的组织结构。这种组织结构对于公司未来状态的运营发展将是至关重要的。
设计面向未来的运营架构
信息系统整合，必须精心策划，以最大限度地创造价值，降低成本，并实现整合的目标。这包括IT 核心业务流程，如系统开发及交付，数据管理和基础设施的配置，集成的IT 支持流程，如第三方服务，报告体系，操作程序和控制体系，包括治理方式和内部政策，并使用特定的工具。
第一阶段：信息系统迁移运作模型及资产清点
此阶段利用两个关键工具指导总体信息系统整合流程。信息系统迁移运作模型可看作迁移基准，包括现状、中期及最终阶段模型，为系统组织开发及实施定义了关键组件( 流程、应用、数据、基础设施、人员)。必要的总体评估及资产库存清点可确保全面的整合分析，在贯穿整合流程中识别风险相互依赖关系及制定恰当的决策。此阶段包括以下三个关键组件：业务应用及系统、关键基础设施及硬件，以及供应商合同和许可证授权。
第二阶段：差距分析，合理化，选型
此阶段开始以差距分析、合理化和选型方式对系统整合流程进行详尽的分析，具体包括以下三方面：业务应用及系统、关键基础设施及硬件，以及供应商合同和许可证授权。该流程应包括将两个不同的系统环境进行整合时，可实现的节省成本、提高收益或风险规避的评估。
第三阶段：提议项目组合– 信息系统整合路线
提议的项目方案包括为取得预期的最终状态而需要落实的行动，并解决在差距分析中识别的具体差距。该阶段也应包含对现有项目的合理化处理，以及各IT 项目方案的重新评估和优先级重新排序，以合并满足短期和长期的系统整合需求。当获得管理层的批准后，该方案将成为信息系统整合路线的基础并提供在组织中管理多个IT 投资项目的架构。通过信息系统整合路线图，管理这些项目投资以创造价值，并确保透明及可问责的项目管理方式，从而达到信息系统及总体整合的最终目标。
第四阶段：信息系统整合路线部署
当信息系统整合路线被批准后，公司应当在项目和具体业务，乃至公司管理层中建立用于管理系统整合工作的渠道。项目初始阶段参与者的热情与专注非常容易减退，因此基于健全项目管理原则和方法的执行框架应当在整合项目的初期尽早建立。能否维持一个透明和可度量的整合管理流程往往决定系统整合工作的成败。
信息系统的整合应当被视为实现并购目标的有利的工具。保证信息系统整合成功的先决条件，就是采取一种全面、综合风险管理的方法，规划先行，规范管理并有序执行。 ..
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