协同办公系统主要模块如下：

1、协同办公系统实现分布式办公和移动办公。单位智能化的协同办公系统支持分支机构、跨地域的办公模式以及移动办公，方便所有员工快捷高效完成日常办公。

2、实现文档管理自动化。协同办公系统可使各类文档都能够按权限进行电子化保存、共享和使用。

3、协同办公系统实现业务辅助办公。它牵涉的内容比较多，像考勤管理与和合同管理等与我们日常事务性办公工作相结合的各种业务辅助办公自动化。

4、建立信息发布平台。协同办公系统在内部建立一个有效的信息发布和交流场所，使内部的公文通知、规章制度、新闻简报、公告事项等能够在企业内部员工之间得到广泛的传播，使员工能够了解单位的发展动态。

5、实现工作流程自动化。对于企业内部存在的大量流程化工作，例如各种审批、请示、汇报、异常出勤、报销等，通过工作流程的信息化处理，规范各项工作，协同办公系统能够提高单位各部门、各岗位间协同工作效率。

以上主要是协同办公系统都能最终实现企业的战略目标所具备的功能模块，但是再完善再好的协同办公系统在企业选择时，也需要根据公司单位内部的需求和实际情况来选择相应的，否则再好用的协同办公系统不适合企业内部办公也是浪费了成本。