由于使用项目工程管理企业和行业的复杂性会使得整个工程管理系统的管理类型也多种多样，工程管理系统根据不同的要求来进行不同的分类。工程管理系统大致可以按照以下三个标准进行分类，按管理方法分类、按量度进行量化分析、按管理目标进行划分。
1、按管理方法划分工程管理系统的管理方法分为行政管理、经济管理、管理技术，这几个都是最常用的分类方法，其中工程管理系统的行政管理方法是指上级领导人直接利用其权利对管理的对象直接进行考察，工程管理系统具有直接性还比较注意科学性。工程管理系统的经济管理方法是应用经济的手段来进行管理例如实施承包制度、项目资金的分配等以奖励的方式来充分调动大家的积极性。工程管理系统的管理技术是这几个被广泛应用到其中，这类方法比较具有科学性和高效性。
2、按量度进行量化分析工程管理系统按照量度一般是有定性方法、定量方法和综合管理的方法，综合管理是将定性和定量的方法结合在一起而定性是一种经验的方法。
将工程管理系统进行不同的分类，一方面是根据功能另一方面是依据性质来进行不同的分类。根据不同的要求来进行不同的分类。
3、按管理目标划分工程管理系统划分的标准不同自然标准也就不同，所以可以分为进度管理方法、质量管理方法、成本管理方法、安全管理方法等类型。不同的工程管理系统管理方法自然能形成不同的形式。
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