ERP普通定制化问题的产生，大都是受企业原有的旧系统、企业组织文化和管理方式的不同而有所不同。因此，对于ERP系统厂商或顾问而言，这类的定制化需求，通常是无法事前预知的，最好也不要直接建议企业以定制程序方式来加以解决。
1、受旧系统影响所产生的定制化需求
许多企业在导入ERP系统的过程中，都会习惯地将原有的旧系统所提供的工作方式与功能，拿来与ERP系统做比较，因而产生定制化的需求，但这些定制化问题的发生并不一定是绝对必要的，往往只需要经过企业流程再造(Business processreengineering，BPR)来重新适应ERP新的工作流程与操作方式就可以解决。
2、受公司文化影响所产生的定制化需求
每个公司都会有其牢不可破的公司文化与工作、运作模式，当企业进行ERP系统导入时，若非ERP系统没此功能，就是ERP系统所提供的功能不符公司所需，此时就会有定制化需求的产生。
例如大部份的ERP软件都提供了简单的Sales佣金计算功能，但企业在实际运作上，其Sales佣金计算方式可能要复杂得多，且牵涉到的层面又广，像此类的定制化问题，势必也只能依照各公司的实际需求另行定制。
3、因特定核算方式不同所产生的定制化需求
虽然大多数ERP系统都自己宣称可以提供最佳的工作、操作流程与模式，但各公司往往仍有为达到特定核算要求而有定制化需求的产生，但此类定制化需求以输出报表居多。
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