从功能层面看，ERP系统涉及物流、生产、财务等企业数据的处理和分析，以业务流程为主线，对人、财、物等资源进行全面整合，是一种可以实现跨地区、跨部门甚至跨公司整合实时信息的企业管理信息系统，是高度集成和标准化的企业管理系统。
ERP能够对企业相关的业务与数据进行分析，帮助企业管理者进行决策。OA办公系统则用于无纸化办公，是企业的工作审批和知识管理平台。OA办公系统可以消除信息孤岛，擅长协同管理，使企业上下不同部门之间形成一个完整的协同网络，大大提高了运作效率。
其次，OA办公系统是组织行为管理软件，偏向对人的规范、文化管理。ERP则偏向对事物、业务数据的管理。从管理的本质来看，OA办公系统重在协同管理，强调人与人、部门与部门、跨组织间的协作管理。ERP重在企业资源计划管理，强调企业资源(生产)的精细计划管理。
事实上，OA和ERP的关系是非常微妙的。OA办公系统不擅长处理企业内部资源之间的数据关系，而ERP不擅长协同管理以及工作流审批。但企业同时引进两个信息系统后，OA办公系统就能充分发挥企业协同办公的能力，对ERP进行弥补。而ERP也能弥补OA办公系统的不足，实现企业信息化管理的最大效用。
值得一提的是，很多企业目前多是分阶段上线OA和ERP，这样一来可能出现的问题是选择不同的供应商的产品，不但成本高，而且数据集成难度大，造成信息化重复建设的浪费。为此，建议大家在选型的时候最好选择同一个供应商的产品，当然最好的选择是选择“一个设计、一个系统”设计的一体化管理系统，系统包含了OA、CRM、ERP、HR、项目管理、采购管理等模块，企业按需采购，灵活应用。这样不但能够减少信息化建设的成本，而且易拓展，易上手，降低信息实施的风险。
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