但是医药行业的仓储情况不同于他行业，相对来说会复杂的多，要技术方面也是要求比较高，在我们追求“零库存”的目标，更要注重是：控制好药品的质量。
医药物流仓储管理难点：
1. 药品的质量管理难度
医药物流区别于其他物流最明显的技术方面的差别在于冷链方面，冷链物流对于专业性技术性的要求比较高，且冷藏药品在医药流通企业当中的销售额接近10%左右，且成逐年上涨趋势，新的GSP管理标准中对于仓储温湿度监控，自动检测等都有着较为明确的要求，这也预示着冷链物流设备将成为大型医药物流企业的标配，同时，也将迎来难得的机遇。
2. 信息化系统难度
药品与其他商品在管理上有处很大的不同，就在于同一种药品有多种批号，而国家对药品的批号控制相当严格，要求药品经营企业能准确掌握每一批号药品的信息。
一家年销售额在4亿元左右的药品流通企业经营的药品大概有5千种左右，而算上同一种药品不同批号的情况则能达到7—9千种品规，每一种批号的药品必须按照不同的药品进行存储管理，这是药品仓储管理难度所在。
由于医药行业的经营特性，对同一家药品流通企业而言，同一种药品每批次的进价也可能不一样。如果企业要对药品的价格实行批次管理，那么就必须要强大的仓储管理软件才能支持。
当今企业越来越重视供应链管理的思想，其主要的两个组成部分：采购管理与库存管理也受到了越来越多的关注。采购管理就是指为保障企业物资供应而对企业采购入库进行的计划、组织、协调和控制等活动。库存管理是指在保障供应的前提下，以库存物品的数量来达到最少和周转最快为目标所进行的计划、组织、协调和控制。
库存管理是对在库物资种类及其存量的管理和控制，它只考虑其合理性、经济性与最优性，而不是从技术上考虑存货的保管与储藏以及如何运输.随着企业行业的发展，企业的经营规模正呈现出上升的趋势，企业间的竞争也越来越大，但竞争已不再是规模的竞争，而是出库业绩的竞争，如何在激烈的竞争中扩大出库额、降低经营成本、扩大经营规模，成为企业营业者努力追求的目标。
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