企业资源问题是制约中小企业信息化的主要瓶颈之一。根据研究与实践分析表明，主要表现在以下几个方面：
1.信息化目标不明确。我国很多中小企业不了解管理上的问题正严重制约企业的发展，不了解信息化能够解决的正是管理上的问题，不了解过去的优势正在消失，如规模，品牌，成本，技术，市场等，不了解竞争的焦点是什么。对企业信息化缺乏应有的认识，从而容易导致企业陷入“IT黑洞”。
2.组织人员的阻碍。企业信息化是一项很大的工程，它的实施会对企业全体员工产生影响，同时也需要全体员工的配合。组织人员的阻碍，会对企业信息化产生严重的不良影响。如缺乏企业管理高层的支持。中层管理者消极实施管理，企业员工面临着裁员恐慌而不积极配合，管理部门不认真，大量的协调问题使进度一拖再拖。
3.资金短缺问题。实施信息化早期需要一次投入很高的成本，其后还需要持续的运营成本，这些费用对中小企业来说都是不小的财务负担。调查表明由于资金短缺也是造成企业信息化失败的主要因素之一。
4.理解偏差。主要表现在中小企业对信息化概念认识不清，对信息化认识过于简单化，对信息化项目的实施抱以过高的期望，把信息化等同于技术改造，如让技术部门主持信息化，选型中盲目追求软件的高档次和高功能，没有意识到行业性限制，对实施信息化存在不切合实际的想法，比如认为信息化可以解决一切问题，信息系统可以代替企业家和管理人员等等。
5.人才缺乏与人才流动大的问题。人才是企业成功实施信息化的前提条件，中小企业信息化缺乏高水平的系统管理与网络管理人才，也常常面临人才外流问题的困扰。
6.经营管理的问题。这主要表现在①对信息化计划实施费用与进度预算失误；②不可预见的财务风险；③实施中的控制偏差与技术的吸收消化能力的不足；④对信息系统维护的漠视。
7.对自身信息化的基础缺乏研究。如企业自身的管理的规范化程度，对管理瓶颈问题的识别(目标是否清楚)，管理人员素质(特别是CIO、CFO)，管理层的接受程度(动员和准备程度)，实施贯彻的力度，信息化的经验等等。
8.缺乏信息化评估体系。对企业信息化的投资效益分析做得不够，企业往往不清楚哪些地方正在凸现效益，哪些地方正在白白地}肖耗资源，造成企业投资不平衡、不合理。
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