实施EHR项目是一个系统工程，同样也存在着风险，为此在项目实施中应时刻保持风险意识，尽量避免风险。项目风险主要体现在以下几点： ①违法、违规风险：系统如果不符合政府法规和行业的要求，会影响企业正常业务的开展，损失会难以估计。 ②进程风险：如果项目实施范围和边界不明确，会造成项目不能按期完工，不能达到预期效果，造成项目失败。这是企业和供应商都不愿看到的。 ③管理观念转变的风险。EHR带来的全新管理理念与企业原有管理理念的冲突如不能很好的得到解决，会造成项目不能顺利实施。 ④流程改造风险：项目实施会对现有组织架构和职责进行调整，涉及流程改变、权力划分等，如果处理不当，也会造成风险，影响企业业务运行。 ⑤数据安全风险：系统实施后，数据集中于在数据库集中存储，网络化运行，数据安全风险加大，需采取各种措施保证系统安全。
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