B/S架构的手机OA办公系统应用优势集中体现在以下几个方面：
B/S架构的手机OA办公系统实施周期快、安装成本低 C/S的实施需要在每个手机上安装软件以及配套的防火墙、杀毒软件等，但涉及到的手机本地环境千差万别，因此环境配置难度大，而且手机配备者很难集中将手机交给管理员安装和调试，而且手机配备者往往处于出差、外出、开会各种状态，因此经常采用见缝插针、一对一辅导和安装的模式，实施周期会比常规实施拖延很久，耗费的人工安装成本大。
办公软件专家-伟创软件认为，B/S的实施无需在手机客户端安装任何软件，只需要在服务器端集中安装一次，因此1个小时就可以搞定，其他的OA用户，可以轻松的通过手机浏览器登陆OA系统，进行工作处理。
B/S架构的手机OA办公系统服务维护工作量小，维护成本低 C/S的OA应用，出了问题，需要协调每个使用者，并且在每个使用者的手机客户端去做问题检查和处理。 而B/S的OA应用，出了问题，只需要在服务器上做操作，就可以完成对全员的问题应对，因此服务维护工作量、服务更便捷、维护成本低。
B/S架构的手机OA办公系统安全方案成熟、安全措施部署简单、安全性更好 C/S的OA应用在数据查看过程中以及退出OA系统之前，数据都下载到了本地数据库，因此很容易被本地的其他软件后门把数据截走，包括通讯录、审批意见等等，这可能将是单位最大的泄密隐患。而且手机应用推出时间早，各种安全措施不齐全，手机又多是个人的财产，无法由单位统一对手机的安全措施进行要求、检查和部署，因此隐患严重。
而B/S的模式采用的数据在服务器集中管理的模式，因此不会遭到其他手机软件的后门攻击，数据更安全，而且安全措施也只需在服务器做各种防火墙、杀毒、VPN等策略的设定，客户端无需做任何处理，因此部署起来更简单、安全措施也更可靠。
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