1、认识不足束发展
中小企业决定要实施ERP系统前，必须对其要有一定的认识，知道专业中小企业ERP系统是什么，怎么实施，难度在哪，如何配套等等。
但目前中小企业并没有对此做好充分准备，在认识上，国内中小企业存在四个方面的不足：一是中小企业的主体地位认识不足。当前很多中小企业往往形成理论主体化或供应商主体化，中小企业只是掏钱者，在实施中出现管理旁落，导致很多项目成了马拉松工程。二是对机构重组的艰难程度认识不足。许多中小企业或许因为内部整合重组较难，因而在ERP系统实施中，造成组织架构安排上缺乏准备。三是对一把手的战略定位认识不足。
事实上，一把手的责任和职责就在于，在实施专业中小企业ERP系统中，着手解决新矛盾，填平新旧关系等。四是对ERP系统实施中的战略对应要求认识不足。中小企业ERP系统实施中，既要求标准化，同时要求柔性调和，但中小企业往往强调一方，忽视另一方。
2、方案缺失埋隐忧
在所有造成中小企业ERP系统失败率高的原因中，项目实施方案存在重大缺失成为最为关键的因素。根据对收集到接近1000个中小企业ERP系统方案的调查显示，相当一批方案不具备方案的水平和条件，而“其中相当一批方案的内容竟不符合编写实施ERP系统方案的要求、要领和基本常识”，最终不少都出现了“实施拿另一招”的情形。
调查也同时表明，“好方案太少”，其中为客户进行增值性思考和集成性思考的不足10%，能够量化给客户带来商务影响和经济分析的方案不足5%。专家分析，目前国内中小企业ERP系统在方案上缺失主要包括功能性不足、安全性不够、扩展性不保等，统计显示，有这些问题的方案约占四成左右。
3、服务链亟待完善
对于中小企业信息化，服务是维护发展的重要因素。而目前国内中小企业ERP系统过程中不得不面临服务链断裂的困境
专业中小企业ERP系统实施服务链应具三个层次，一是环境服务链。目前“我国服务环境还不完善”，国外中小企业实施ERP系统时候，要进行风险鉴定和风险评估，但中国现在还找不到风险评估系统。二是实施服务链。现在国内中小企业在此方面还缺少第三方的咨询，缺少客观声音。三是运行服务链。“很多中小企业上马ERP系统，上马了失败，上马了又下马，来回折腾”，原因就出在运行服务链的断裂。为此，运行中要进行对应性培训，真正进行深入的培训，并进行完整流程的复合性验证。
事实上，在中小企业ERP系统领域中，对于成功的定义，一直存在各种理解。成功应具三条：一、符合中小企业总体发展战略；二、实现预期业务的功能和管理目标；三、达到预期的收益和成本的平衡。不过，按这三条标准来衡量，国内多数实施ERP系统的中小企业存在两个不明确：应用方没有明确的目标需求；实施方没有明确的服务目标，最终导致了失败。
而这种趋势也正在向广大中小企业扩散和延伸，正确认识专业中小企业ERP系统存在的问题，也应引起各方重视。 ..上海企业企业ERP系统软件专题
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