由于OA与ERP分别属于不同的管理系统，他们的融合应用势必要经历重重困难，具体来说，包括以下几个方面：
1、数据不一致。传统厂商利用昂贵的EAI方法将两者连在一起，通过集成OA与ERP中相似但不一致的元素来实现一体化，元素之间的关系是偶然的，容易形成筒仓系统，数据出现冗余、不一致现象。
2、功能拓展困难。由于OA与ERP有可能使用不同供应商的不同产品，接口设计不兼容，无论是OA系统向ERP系统拓展，还是ERP系统向OA系统拓展，都需要对接口进行二次开发，非常耗费精力。需要及时与精准的数据来进行端到端精细化的管理，集成后的筒仓系
3、系统成本高。传统厂商只是生硬地将OA与ERP连接在一起，OA与ERP仍然使用各自的一套硬件、系统软件及数据库，成本非常高，且后续的维护和升级将带来更多的成本，企业苦不堪言。
OA系统与ERP系统融合应用势在必行，却在融合过程中出现了种种困境，他们之间的矛盾似乎不可调和，如孪生兄弟般紧紧连在一起，这让许多企业左右为难，“OA+ERP”成为了萦绕在他们心中挥之不去的字符。
作为企业内部运营管理、业务管理的代表性应用软件，OA与ERP一直都在各自的领域扮演着重要的角色，OA主要用来管理表单流转，强调人与人、部门与部门、跨组织间的协作管理；ERP则重在企业资源计划管理，侧重于企业业务数据的处理、分析和挖掘。可以说，OA解决的是企业内部组织体系运作的协同管理问题，ERP则是以业务数据处理为核心的业务流程管理。两者看似彼此独立，互不干扰，但是随着现代管理理念以及企业管理需求的不断发展，两者“在一起”的呼声越来越高涨。
首先，随着现代管理理念的不断更新，OA的内涵不断外延，已经不仅仅局限于办公自动化，更是着眼于企业业务流程的管理，“大OA时代”已经来临，OA与其他企业管理软件的融合使用成为了一种趋势，其中，OA+ERP更是为企业津津乐道。OA与ERP的融合使用，可以实现管理层在OA系统审批时直接从ERP系统抓取相关业务数据，为管理层审批提供参考。
其次，随着企业2.0时代的到来，传统ERP已发现了自身的局限性，其渴望也能够像OA一样实现人与人、部门与部门、跨组织间的协作管理，已然进入大协同时代。同时，ERP与OA 融合应用，可以通过OA系统，将ERP系统数据产生、审核等流程信息进行记录跟踪，弥补ERP系统数据形成前与形成过程不能进行跟踪的不足。
OA与ERP，两者的完美融合，能够将流程管理与业务运营管理紧密地结合起来，把过程性的结果给到结果性的系统，让结果性的数据为过程性的工作提供支撑；除管理表单流转外，还对业务与运营事件进行管理，促进业务信息快速且又精准地在各个业务环节流转，有效地完成对企业经营过程运行的支持。
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