1、流程管理系统涉及的面太广
没有任何一个管理软件能解决企业的所有问题，流程管理系统也不例外，所以对系统的实施需要做好整体规划和分步实施，涉及的范围太广导致各方面的投入太大，流程管理系统实施的周期延长、风险大、造成成本和资源的浪费，容易导致项目的失败。
2、流程管理系统没有结合自身的需求
企业管理特点千差万别，个性化的流程管理系统需求是必然，需求不能完全依赖流程管理系统厂商，只有适合自身的功能才是最好的。流程管理系统实施应该是紧密围绕自身的需求来进行，借鉴软件厂商的行业经验和产品的积累，这样流程管理系统中表现出“通用性”和“个性化”两大特点。因此，没有结合自身需求的流程管理系统，必然会导致用户满意度低和软件适应性差。
3、需求过于简单
很多用户没有对自身的需求进行分析和整理，提出需求的时候往往过于简单，在实际应用中发现很多功能没有涉及，如：很多企业只是使用了信息发布、通知公告、文件资料的存储等简单功能，这样必然导致流程管理系统不能够得到深入的应用，当然也导致流程管理系统实施效果差。
从以上我们可以看出，用户需求是流程管理系统实施的目标和根本，只有围绕用户需求进行实施才能确保流程管理系统实施效果。
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