协同软件与OA有着深厚的渊源和密切的关系，这使人们容易混淆协同软件与OA。我们可以通过分析两组概念不同的软件及其发展，来理解协同软件与OA的区别。
参照ERP与财务软件的区别，看协同软件与OA的应用范围不同。1998年ERP(企业资源计划，Enterprise Resource Planning)开始在我国广受重视，我国许多从事财务软件和MRP/MRP业务的软件厂商，纷纷转向ERP。其中，以财务软件厂商的转型最为成功，用友、金蝶是其中的杰出代表。由于历史原因，以及部分厂商的有意误导，使得一些用户曾经难以分辩财务软件与ERP的区别。到底财务软件是不是ERP软件?理论界应该是非常清楚，但在用户层面，往往很难分辨。其实，ERP中有一部分是面向财务管理的，那些基于ERP的财务软件，可以看作ERP的有机组成部分。财务软件不能等同于ERP，特别是那些传统的以财务为中心的软件，更不能贴上ERP的标签。参照ERP与财务软件的区别可以看出，协同软件与OA涵盖的应用范围不同。例如：协达CTOP协同软件，采用了世界先进的SOA(面向服务架构，Services-Oriented Architecture )技术，“所见即所得”和“随取即需”的功能特点，使该软件灵活、开放的功能，不仅可以实现OA的应用，还可以应用于人事、客户、供应等领域，甚至支持政府业务处理、企业CPC(产品协同商务，Collaborative Product Commerce)应用。
参照ERP与MIS的区别，看协同软件与OA的核心理念不同。MIS(管理信息系统，Management Information System)曾经是广为普及的一个计算机应用理念，这一理念几乎与我国的计算机应用同步产生，并经历了长达几十年的发展。ERP出现后，MIS越来越少被提及。和ERP与财务软件的区别不同，ERP与MIS的区别不在于所涵盖的功能，而在于各自的核心理念。和MIS一样，ERP也涵盖了人、财、物、产、供、销等管理的方方面面，但ERP是以“资源计划”理念为核心，来构建管理的不同层面，而MIS系统仅仅是信息的收集、记录、反馈。参照ERP与MIS的区别可以看出，即便广义的OA软件可以包含与办公有关的方方面面，但协同软件与OA的理论基础不一样，OA强调的是以计算机为手段“自动化”地完成各项工作资料的记录与反映，而复旦协达、点击科技等协同软件关注的是群组、团队的协作与沟通。
严格来说，我们很难以上述两组软件的区别，来完全说明协同软件与OA的不同。但可以通过对上述两组软件的分析方法，来澄清目前业界部分存在的协同软件与OA的概念混淆，并且可以看出协同软件未来总体发展方向。
与财务软件引入ERP理念、企业MIS系统被ERP所取代一样，传统的OA、电子政务、电子商务等软件会充分吸纳协同管理理念，成为协同OA、协同政务、协同商务。目前，协同软件的概念和应用，还处在推广普及期，对协同软件予以正确引导有利于这个行业的健康稳定发展。我们即要释清对协同软件的诸多疑虑，以更为积极的态度迎接和推动协同软件时代的到来，也要防止肆意张贴“协同”的标签，以免“ERP泛化”的情况在协同软件领域出现。
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