HR系统是指通过信息化进行人力资源管理。OA系统是指通过信息化实现办公自动化，帮助企业协同办公。
一、功能模块不同
OA系统主要围绕行政部门的业务展开的，其主要功能模块有：流程管理、办公管理、通讯录、即时通讯、公告通知、文档管理等。而HR系统则是围绕人力资源部的业务而展开的，一般HR系统的功能有：人事档案、考勤管理、培训管理、考核管理、薪资管理、异动管理、招聘管理等。
二、使用者不同
OA系统的操作者主要是行政部门等管理人员，全体部门的人员都可以进行信息查看。HR系统则是提供给人力资源部门使用的。通常OA系统的操作的全部权限分配给行政人员，每个功能点的权限根据部门主管和员工的不同，给予不同大小的权限。比如，不同的流程，部门主管有审核本部门员工的权限，普通员工只有填报的权限。
HR系统的管理权限主要分配给HR，根据所负责的工作内容不同，通常分为两种角色，即薪酬主管和人事专员。前者可操作员工信息管理、劳动合同管理、考勤管理、薪酬管理、培训、数据分析等模块。后者可协助薪酬主管操作除薪酬管理之外的其他模块。
在HR系统方面，通过员工档案、员工合同功能，规范人事管理，规避法律风险；通过便捷的考勤记录，灵活的休假、加班、外勤功能，轻松统计员工出勤情况；通过薪资福利功能，快速自动计算员工工资。
在OA系统方面，通过企业公告、及时通讯、工作日历、工作日志等基础性协同办公功能，有效加强企业内部沟通；通过可配置的办公申请和审批流程、采购流程及审批流程，建立适度有效的内部管控，提高企业运作效率。
HR系统与OA系统在哪些方面存在差异？两者的侧重点不同，两者的管理对象是也不同，一个侧重在“财”和“”物“，一个是”人“，HR系统的重点是管人本身，OA系统是管人和人之间的协作与沟通。
