HR系统的作用不仅在于人力资源本身的管理，更重要的是，只有通过HR系统的严格管理，才能保证各种基础信息（如部门、职务、岗位、功能权限、数据权限）的准确性，这些信息是公司管理的基础，也是其它关联系统如OA系统、培训HR系统使用、付款审批及预算系统高效运行的基础。
HR系统涉及的内容较多，也比较复杂，因此如果员工人数较多，最好也是在OA软件正常使用三个月以后，再考虑使用HR系统。在此之前，先不要启用HR系统（启用后就必须改用人力资源管理的相关流程，而且启用后不能再停用）。因为在使用OA系统、培训HR系统的过程中，可以先了解HR系统的操作习惯，以及各种基础信息（如部门、职务、岗位）的设置是否合理，这些信息是HR系统最重要的基础信息，如果前期设置得不太合理，那么在只启用了OA、培训系统的情况下便于调整和优化（如果启用了HR系统，修改起来工作量要大很多）。这样相当于把一个复杂的工作分步实施，有利于逐步了解系统并把系统使用好，显然是更方便的。
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