LIMS实验室管理系统发展至今，大体经历了以下几个阶段：
1、雏形期：60年代末期-70年代初期这一时期是LIMS实验室管理系统设计思想的产生时期，实验室的数据管理仍然停留在手工记录阶段。
2、商品化时期：70年代中期-80年代末期，大规模集成电路的普及使得仪器的自动化水平大大增强，进而实验室单位时间内所能完成的测试任务大大增加，这就对实验室的管理提出了新的要求。这一时期的LIMS实验室管理系统系统操作一般集中在中心计算机上完成，可以实现一般的数据管理与统计分析功能，数据处理能力比较小，手工处理的工作量仍然比较大，其它功能还没有实现。同时随着计算机数据处理能力及数据吞吐量的极大提高，采用计算机信息系统来自动管理实验室成为可能。因这个时代的计算机语言和网络技术还不够发达，计算机的价格比较昂贵，需要专业的技术人员编写与维护程序。
3、功能完善时期：80年代末期-90年代中后期伴随着这一时期计算机技术的飞速发展，LIMS实验室管理系统技术进入一个崭新的发展时期。LIMS实验室管理系统在西方发达国家迅速得到推广。此时，计算机(PC机)价格开始大幅度下降、而性能却大幅度提高，基于第三方的关系型数据库技术与网络技术已经成熟，系统一般采用PC作为数据终端，网络体系的建立比较容易。
C/S构架的数据管理模式成为主流，数据处理能力大大提高。由于实验室规模一般都不大，随着MSWindows、WindowsNT操作系统的兴起，基于该平台开发的LIMS实验室管理系统开始流行，LIMS实验室管理系统开始从DOS平台、UNIX平台逐步过渡到Windows、WindowsNT平台，这个时期的产品一般都具有良好的用户界面，操作比较简单，功能比较全面，性能价格比较好，吸引了越来越多的用户。由于新一代数据库和面向对象设计软件的大量涌现，通过简单学习，一般技术人员也可以象专业技术人员一样采用面向对象编程技术简单设计数据管理软件、建设结构简单的网络。
4、网络化产品的兴起：90年代后期-21世纪90年代后期，Internet技术以令人不可思议的速度飞速发展，各行业均被卷入了互联网的大潮之中，网络技术的应用遍及各种工业技术当中。新一代的数据库设计与网络设计都或多或少带上了Internet的特点。采用Internet、Intranet和Web技术的LIMS实验室管理系统开始出现，普遍采用了统一的浏览器界面和以Web服务器为中心的分布式管理体系，使用极其方便，数据的共享和发布更为简单，功能更为全面，软件的二次开发更为容易，这些最新的计算机网络技术在LIMS实验室管理系统系统中的应用，代表了今后LIMS实验室管理系统技术的发展方向。
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