1、选型风险
很多用户在选型的时候对OA办公系统不够了解，往往过于理想化，提出一些不太现实的想法。而有的厂家为了提高销量，只会一味的迎合用户的喜好，甚至在明知不合理的情况下误导用户，结果让用户采购了不适用的系统，导致项目失败。
还有很多用户过分关注OA办公系统的理念和概念，以为先进的管理思想必然带来先进的管理工具，必然给自己带来脱胎换骨的改变。于是考察产品时走马观花，没有深入了解功能和技术细节，使用后才发现产品和理念严重脱节，产品存在一大堆这样、那样的问题，根本无法实现预期目的，导致企业内上上下下的不满，使得OA办公系统成了摆设。
产品不对，累死实施，合适的产品是项目成功的基石。在ERP软件盛行的时期，业界有个说法是“三分软件、七分实施、十二分数据”，意思是说ERP项目的成功，关键不在于产品，而在于实施。
另外，选型的时候要兼顾未来发展，而不是眼前问题;关注综合成本，而不是购买价格;关注亲身试用，而不是厂家介绍。这样，系统的失败几率就会大大降低。
2、功能风险
OA办公系统的功能越来越多，也越来越复杂，这就造成了一些隐藏的风险，比如下面这两种情况：
1)功能不细致
现在OA办公系统的功能普遍存在一个误区就是求全不求细，求大不求精。有的系统看起来林林总总各种功能都有，但深入的使用后才发现有很多欠缺，比如发送通知时不能设置自动回执和密送，传递文件时不能直接归档、考勤管理时不支持多台考勤机汇总，工作流不支持多种类型的智能跳转，表单不支持数据关联，手机OA的功能太粗糙等等。
2)功能不易用
这个问题一直被厂家所忽略，但却在很大程度上影响了OA办公系统的实施成功率。OA涉及面广，各类型人员电脑水平千差万别，而OA的实施是一鼓作气，再而衰，三而竭，如果系统的操作很繁琐，不能够快速的让使用者产生兴趣，他们的热情就会很快冷却，再好的功能和技术都是空谈。
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