由于我国企业的生产计划模式的复杂以及市场的不确定性大，多数企业的ERP系统应用主要是财务管理和管理会计的功能用得最好，因此在实施过程中一期工程主要是在财务总帐、应收应付、管理会计、物料管理等核心模块的实施上，后续的二期工程难以开展。企业在ERP系统实施过程中涉及到的业务流程重组也主要是围绕上述几个会计和物料模块展开，全面的流程重组还难以实现。
1、国内众多ERP系统企业管理软件商有丰富的ERP系统实施经验,但无科学规范的实施方法，反映出ERP系统公司内部管理的薄弱和对ERP系统实施中的管理问题不重视。
有的小型ERP系统商没有充分理解实施方法和项目管理方法的作用和地位，甚至认为ERP系统实施和项目管理是一个概念。还有某些ERP系统商设立了自己的ERP系统实施方法，但是由于企业内部培训不足和实施能手缺乏，对于项目实施过程中的关键业务活动没有落实，尤其是对企业新旧业务流程的对比缺乏详细的描述，ERP系统实施变成了主要是对软件的技术支持，仅仅针对ERP系统的配置、数据初始化、上线等生命周期中的后续阶段进行处理，导致项目变成了软件实施，而没有针对管理进行变革，实施的风险增加，稍有不慎就导致ERP系统项目的失败。
2、ERP系统商、政府部门都要从自己的角度发表ERP系统实施建议和经验
ERP系统商、提供业务流程重组的咨询公司、政府部门提供的ERP系统服务、倡导第三方监督的监理商都从自己的角度发表ERP系统实施建议和经验,但是企业由于不能全面看到具体的实施周期，使得企业不能深入了解具体的ERP系统实施方法和具体实施 |
